Imran Bunjaku war in der Juniorenabteilung des Grasshopper Club Zürich ausgebildet worden, ehe er während sechs Saisons für den FC Schaffhausen in der zweithöchsten Spielklasse des Landes aktiv war. Insgesamt bestritt er 140 Pflichtspiele für die Munotstädter. Nach einer unglücklichen Rückkehr zu seinem Ausbildungsverein wechselte der frühere U21-Nationalspieler Albaniens im Herbst 2021 zum FC Aarau.