Milot Avdyli war vor seinem Wechsel aufs Brügglifeld in seiner Heimat für KF Trepca 89 aktiv, wo er insgesamt 25 Spiele in der kosovarischen Superliga bestritt. Ausserdem wurde er in den vergangenen Jahren auch regelmässig für die kosovarischen Nachwuchsauswahlen aufgeboten.